Ah, das kommt mir bekannt vor. So einen Fall hatte ich auch mal - liegt aber etliche Jahre zurück, deswegen kam es mir nicht direkt in den Sinn.
Unter anderem trat das bei so einem bestimmten USB-/Gameport-Adapter auf. Der hatte einen Schieberegler, mit dessen Hilfe man zwischen verschiedenen “Modi” umschalten konnte. Das Problem trat nur in einer bestimmten Schalterstellung auf. In der schickte der Adapter offenbar fortwährend Nachrichten an den PC, die dann zu den Systemunterbrechungen führten.
Außerdem habe ich damals eine versteckte Einstellung in der remote.ini eingeführt, mit der man das Polling-Interval heruntersetzen kann, was wohl bei manchen Gamepads auch Abhilfe schaffte: