Ganz so kompliziert müssen die Schritte nicht sein, glaube ich 
Bei mir hat es am Ende (meistens) ausgereicht, einen Verzeichnisbrowser hinzuzufügen, dort eine Datei anzuklicken (so dass der Browser Fokus bekommt), und dann mAirList zu schließen. Aber eben auch nicht immer.
Unter dem Strich scheint es sich um einen Bug in der verwendeten Fremdkomponente (JVCL) zu handeln. Dort gibt es Code, der beim schließen eines Tabs versucht, den Fokus auf die nun sichtbaren Elemente im neuen aktiven Tab zu verschieben. Das schlägt aber beim Beenden fehl, weil die Fenster und Elemente teilweise schon nicht deinitialisiert sind.
Ich habe das Schließen der Browser jetzt noch einen Schritt weiter nach vorne verlegt. Build 6015 ist hochgeladen, tritt es bei dir damit noch auf?