Ich kann das hier auch Anhieb auch nicht reproduzieren.
Im Grunde handelt es sich ja beim “Layout-Designer” nur um das normale Hauptfenster, ergänzt um die Punkte um die Objekte, und eben das darüberliegende Objekt-Fenster. Warum das Hauptfenster minimiert startet, kann ich mir nicht direkt erklären. Lediglich den zweiten Teil, also dass es zum Vorschein kommt, wenn du es ein zweites Mal über das Startmenü öffnest. mAirList schaut nämlich beim Start, ob bereits eine mAirList.exe läuft, und schickt deren Hauptfenster eine SC_RESTORE-Nachricht, wodurch es dann sichtbar wird und in den Vordergrund kommt.
Was passiert denn, wenn du 1-2 mal auf das Taskbar-Icon klickst? Damit sollte man doch grundsätzlich Programmfenster minimieren und wiederherstellen können. Zeigt das irgendeine Reaktion?
Fensterpositionen werden übrigens allesamt in der preferences.ini gespeichert. Die könnte man mal testweise löschen/verschieben.